Dahulu Morotai pernah digunakan sebagai pangkalan perang pasukan Amerika Serikat pada masa Perang Dunia (PD) II yang berlangsung tahun 1939 – 1945.
Karena itu, Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan RI berupaya untuk mengabadikan bukti-bukti peninggalan PD II yang ada sebagai cagar budaya Indonesia. Upaya ini bakal direalisasikan melalui pembangunan sebuah museum di Morotai.